花蓮馬太鞍溪堰塞湖溢流事件造成重大人員傷亡，花蓮地檢署已主動分案偵辦，調查是否有人為過失。事件發生後，林業及自然保育署透過官方YouTube頻道發布解說影片，說明堰塞湖狀況及警戒通報過程。然而，罹難者家屬質疑未收到撤離通知，與花蓮縣長徐榛蔚當面對質。花蓮縣政府則澄清，網傳「林保署九次示警而縣府延誤撤離」的說法並非事實，強調在收到潰堤風險通報後已立即執行強制撤離。

林業及自然保育署在官方YouTube頻道上發布了一段三分鐘的解說影片，使用自製道具配上旁白，向民眾說明馬太鞍溪堰塞湖的形成與狀況。影片中解釋塞住河道的土石稱為「壩體」，並表示此次颱風是依照大豪雨情境設定警戒範圍及執行撤離避難作業。林保署特別強調已向花蓮縣政府發出紅色警戒通知單，要求進行疏散。

然而，罹難災民家屬向花蓮縣長徐榛蔚陳情，表示從未收到撤離通知。一位劉姓災民在與徐榛蔚的對話中表示，他的母親已經罹難，姐姐下落不明，而他本人則是爬上屋頂等待救援。劉先生指出當地居民多為重聽老人，無法聽清廣播內容。徐榛蔚則回應表示縣府確實有派人廣播，並有村長、里長前往通知。

針對網傳「林保署九次示警而縣府延誤撤離」的說法，花蓮縣政府在9月25日再次澄清，表示所謂的九次示警實際上是自7月26日開始觀測堰塞湖後累積的第九封通報行政文件。縣府強調，在林保署於9月22日上午7點發布潰堤風險通報後，縣府與地方鄉鎮公所已同時進行強制撤離。

花蓮地檢署於9月24日主動分案偵辦此事，表示由於事件造成重大死傷，調查是否有人為疏失是正常程序。目前檢方已向花蓮縣政府、第九河川局及林業及自然保育署等單位函調相關資料，待資料齊全後將決定是否有傳喚相關人員的必要。